Μια και βασική αιτία της ατμοσφαιρικής ρύπανσης αποτελεί η χρήση καυσίμων για την παραγωγή ενέργειας, είναι αναγκαίο οι ενεργειακές επιλογές να συνδυάζουν την ανάπτυξη με την περιβαλλοντική προστασία.
Το φυσικό αέριο είναι το πιο καθαρό και με τους χαμηλότερους ρύπους σε σχέση με όλα τα υπόλοιπα συμβατικά καύσιμα.
Η καύση του παράγει λιγότερο διοξείδιο του άνθρακα, οπότε υποκαθιστώντας τα άλλα καύσιμα συμβάλλει στη μείωση του φαινομένου του θερμοκηπίου.
Δεν περιέχει ενώσεις θείου που ρυπαίνουν το περιβάλλον και προκαλούν το φαινόμενο της όξινης βροχής.
Η καύση του είναι καθαρή και πρακτικά δεν εκπέμπει αιθάλη και αιωρούμενα σωματίδια, περιορίζοντας την ατμοσφαιρική ρύπανση.
Ενδεικτικά στο κάτωθι πίνακα δίνονται οι εκπεμπόμενοι ρύποι κατά την καύση του φυσικού αερίου σε σχέση με άλλα καύσιμα (σε g ρύπου ανά kWh εισαγόμενης θερμότητας καυσίμου).
| Τύπος καυσίμου | Διοξείδιο του Άνθρακα | Διοξείδιο του Θείου | Μονοξείδιο του Άνθρακα | Μονοξείδιο του Αζώτου | Υδρογονάνθρακες | Σωματίδια |
| Μαζούτ χαμηλού θείου | 260 | 1,147 | 0,046 | 0,0439 | 0,015 | 0,150 |
| Πετρέλαιο θέρμανσης | 249 | 0,056 | 0,045 | 0,189 | 0,015 | 0,023 |
| Πετρέλαιο κίνησης | 244 | 0,054 | 0,044 | 0,185 | 0,015 | 0,022 |
| Υγραέριο | 227 | 0,000 | 0,025 | 0,157 | 0,006 | 0,007 |
| Φυσικό Αέριο | 177 | 0,000 | 0,022 | 0,137 | 0,005 | 0,007 |
